由于位于东郊的南京紫禁城距离钟山太近，朱元璋担心有人在钟山上炮轰紫禁城，就下令修建一道外郭城。
南京城是依水而建，东南两面是陆地，北面是玄武湖，西边是秦淮河，都是南京的屏障。
在城外除了四周山川的天然屏障，还有六座卫城，经过数代的修建，这些城防结构非常的完善。
南京城楼雄伟壮阔，俯视全城一览无余，城墙宽达五丈，可容多骑并排。
上面放置了床弩、投石器、火炮一类的大型城防武器，而且分为上下两层，可谓是固若金汤。
南京紫禁城的布局和北京紫禁城内几乎一模一样，从南门的午门到北门的玄武门，各门各宫殿的名字几乎也都一样。
嘉靖皇帝将北京紫禁城内的奉天殿改为皇极殿，南京紫禁城中的奉天殿依旧叫奉天殿，是举行大朝会的地方。
南京的官员们按照各自班次，规规矩矩站立在金阶下的两侧，垂手侍立，恭迎着神武皇帝的大驾。
虽然心里对神武皇帝到来很不满，不过表面上必须做到恭恭敬敬一丝不苟……
朱慈烺在一群亲卫和护国军武将簇拥下，从奉天殿的正门缓步走了进来。
在他前面开道的是两队神武军的将官们，左右则是胡宝、岳洋、女扮男装的沈云英、神武军统领周遇吉，虎豹骑统领曹变蛟，阎应元……
进入奉天殿，御林军和神武军立即清场，把奉天殿大汉将军和皇宫里所有宫女太监都集合起来。
朱慈烺走到这些人身边，开启系统测试忠诚度，最后发现三百多宫女太监，忠诚度达到70以上的太监八人，而宫女只有二十一人。
朱慈烺决定留下这八个太监和二十一个宫女，剩下的太监和宫女发放安家费遣散回家……
而奉天殿的大汉将军们，基本都是勋贵的人，朱慈烺根本不信任他们，并未测试他们的忠诚度。
最终决定，愿意去京营的可以京营，不愿意去京营的发安家费遣散，就这样南京皇宫和奉天殿上全部变成朱慈烺的人……
没有办法，太多人想要朱慈烺的命，他不得不防，奉天殿和皇宫内外一个外人都不会用，全部有御林军神武军锦衣卫接管。
神武皇帝这番骚操作，顿时把南京一帮勋贵和文官几乎鼻子都气歪了。
文官认为神武皇帝多此一举，勋贵却感觉如此一来，以后想对小皇帝做些什么难上加难了……
众人相互对视一眼，很快一个不知死活的御史跳出来，他对朱慈烺拱手说道：
“陛下，您刚到奉天殿就遣散大汉将军和宫女太监似乎不妥吧？请陛下收回成命……”
朱慈烺没有想到自己遣散大汉将军和宫女太监还会有人开喷，看来此次进驻南京，又让喷子有活干了！
神武皇帝淡淡看这个御史一眼，冷冷说道：
“放肆，朕如何做事，难道还需要你来教？如果想给朕上眼药，你肯定是搞错了对象，退下！”
小皇帝果然不一般，一点面子都不给，这个御史感觉面子掉一地，再次躬身硬杠：
“陛下，身为大明天子，理应以天下大事为主，这些……”
他话还未说完，立即被神武皇帝一声怒喝打断：
“你认为个屁，给朕滚出去，再敢多言廷杖伺候！”
几个文官刚才还上前附议，现在一看风向不对，急忙乖乖退到人群后面……
这个御史没有想到堂堂大明天子，竟然在轰然辱骂言官，顿时气的直翻白眼差点晕死过去，猛喘两口老气哆哆嗦嗦道：
“陛……陛下……有辱斯文啊……”
朱慈烺懒得听他废话，一挥手;
“聒噪，拖出去……”
“遵旨！”
几个锦衣卫立即上前把这个御史拖出去，大殿上空气瞬间变冷，南京文武勋贵们终于体会到什么叫小煞星，他们个个都感觉后背发凉，再没有人敢跳出来……
虽然嘴上不敢放肆，他们心里却都在暗暗叫苦：
“小皇帝果然不按套路出牌，一言不合大发雷霆，比洪武高皇帝还霸道，今后日子不好过啊……”
片刻后，为了缓解尴尬的气氛，魏国公急忙上前躬身说道：
“陛下一路辛苦，臣等为陛下设宴接风洗尘，请陛下入席！”
朱慈烺淡淡道：
“爱卿有心了，今日朕有些困乏，把酒菜送去军营劳军吧，你们也都各自回府……”
“这……”
魏国公顿时一愣，群臣也都瞬间傻眼，随后躬身领旨：
“臣等告退！”
……
群臣走后，朱慈烺传令，神武军虎豹骑驻扎内城小校场护卫皇城安全，随后在宫中设宴……
……
大明虽然实行两京制，但握有决策实权的皇帝和内阁大臣都在北京。
北京的六部衙门也是名副其实的中央权力机构，而南京各衙门多为虚衔，公务清闲，任职的官员被称为吏隐。
南京六部几乎成了摆设，养老的官员、被贬的官员或是明升暗降的官员，基本上都来到了南京六部。
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